為配合第10/2017號法律《高等教育制度》的規定，高等院校須符合高等教育法律所載的組織及管理要件，因此，有需要修訂澳門理工學院的機關設置。為此，制訂了《澳門理工學院章程》行政法規草案。

草案的主要內容包括：一、草案建議增設校監。校監為行政長官，主要職權為核准及頒授名譽博士學位及其他名譽榮銜，以及主持各項由學院舉辦的活動及儀式。二、草案建議增設校董會。校董會為負責訂定及執行學院發展方針的機關，成員包括院長、學院的主管及代表、政府代表、校友會代表、學生會代表，以及八至十五名被公認在科學、經濟、社會事務、教育及文化領域有成就的人士；主席及副主席從被公認有成就的人士中委任。

三、澳門理工學院由一名院長、最多兩名副院長及秘書長領導。院長由校董會建議，並由監督實體任免。院長為領導學院學術及行政的最高機關，須向校董會負責。四、草案建議設立行政管理委員會及學術委員會，分別負責確保學院的行政、財政和財產管理，以及指導學院的教學及科研工作，確保學術的高水平及嚴謹性。

五、調整澳門理工學院學術單位組成。學院下設高等學校承擔學術工作，當中包括：藝術高等學校、應用科學高等學校、管理科學高等學校、人文及社會科學高等學校、健康科學及體育高等學校，以及語言及翻譯高等學校。此外，學院按其發展需要，設有獨立學術單位：「一國兩制」研究中心、博彩旅遊教學及研究中心、葡語教學及研究中心、機器翻譯暨人工智能應用技術教育部工程研究中心、教與學中心、持續教育中心，以及長者書院。

六、澳門理工學院可開設並頒授學士、碩士及博士學位課程，以及其他榮銜、文憑及證書。七、澳門理工學院的工作人員，其職務上的法律狀況維持不變，並按原職程及職階轉入新架構。因應組織架構調整，草案建議增加十一名工作人員，年度預算約增加澳門幣八百八十萬元。草案建議自二零一九年八月七日起生效。