《內地和澳門特別行政區關於對所得避免雙重徵稅和防止偷漏稅的安排》（《對所得避免雙重徵稅和防止偷漏稅的安排》）第四議定書生效後，特區政府於內地的投資所得將可獲豁免繳納百分之十的所得稅。有關豁免適用於「廣東粵澳合作發展基金」及日後同類型的投資項目。以粵澳基金的投資金額及年期計算，累計可獲近8億元（人民幣，下同）的稅務豁免。

國家此項稅務優惠安排，減省了特區政府於內地投資的稅務成本，從而提升特區財政儲備投資的實際回報，體現了國家對澳門特區的關顧，並進一步支持澳門參與粵港澳大灣區建設，助力澳門融入國家發展大局。

現時，粵澳基金已按期完成全部認繳出資的投放。根據粵澳基金協議條款，澳方在粵澳基金中的投資，正按照實繳的出資獲年保證收益3.5%，而基金成立以來澳方已可取得相應的盈利回報。此外，當基金總體收益超過一定的水平時，將可獲得額外分成。

由於粵澳基金屬澳方在內地的投資，按內地稅法及相關法律規定，澳方原應為粵澳基金的投資收入繳納百分之十的所得稅。現根據特區政府與國家稅務總局簽訂的《對所得避免雙重徵稅和防止偷漏稅的安排》第四議定書中與「政府投資」稅項豁免的相關條文，特區政府於內地的投資所得將可獲豁免徵稅。以粵澳基金為例，如暫只計算年保證收益，估算獲豁免稅款累計近8億元。

為推動澳門融入粵港澳大灣區建設，貫徹落實《粵澳合作框架協議》，特區政府與廣東省於2018年6月共同成立粵澳基金。粵澳基金作為澳門與廣東省合作參與大灣區建設的一個重要切入點，是兩地創新金融合作取得的首個積極成果。